11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1096 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1097  hypothetical protein  43.66 
 
 		 244 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1530  hypothetical protein  38.54 
 
 		 282 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1339  hypothetical protein  36.28 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  32.35 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2978  peptidase domain protein  34.25 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4313  peptidase domain-containing protein  32.58 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0114  hypothetical protein  32.92 
 
 		 384 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0821  peptidase, metallopeptidase  30.77 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.569838  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4249  peptidase M12A, astacin  27.49 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0499  peptidase M12A, astacin  32.5 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>