12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0499 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0499  peptidase M12A, astacin  100 
 
 		 353 aa  739    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2978  peptidase domain protein  32.09 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4313  peptidase domain-containing protein  30.7 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0821  peptidase, metallopeptidase  38.16 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.569838  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  30.68 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1339  hypothetical protein  28.8 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1097  hypothetical protein  28.65 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1530  hypothetical protein  26.78 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1096  hypothetical protein  32.5 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4249  peptidase M12A, astacin  24.12 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0114  hypothetical protein  25.1 
 
 		 384 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  29.91 
 
 		 495 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>