12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1530 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1530  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1339  hypothetical protein  84.06 
 
 		 277 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1097  hypothetical protein  41.96 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1096  hypothetical protein  38.54 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0821  peptidase, metallopeptidase  30.18 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.569838  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  31.22 
 
 		 394 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2978  peptidase domain protein  34.03 
 
 		 344 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0114  hypothetical protein  29.8 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4313  peptidase domain-containing protein  31.71 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0499  peptidase M12A, astacin  26.78 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2927  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3071  hypothetical protein  24.5 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>