22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2485 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2485  protein of unknown function DUF1706  100 
 
 		 168 aa  348  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2145  hypothetical protein  85.71 
 
 		 174 aa  307  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1110  hypothetical protein  51.5 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2524  hypothetical protein  48.21 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.551325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1462  hypothetical protein  46.39 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1764  hypothetical protein  46.39 
 
 		 171 aa  153  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0636  hypothetical protein  32.02 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1131  hypothetical protein  31.07 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0272678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2111  hypothetical protein  34.38 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1899  hypothetical protein  29.07 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1363  protein of unknown function DUF1706  28.09 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0980  hypothetical protein  27.43 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0763  hypothetical protein  26.22 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1974  hypothetical protein  47.27 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0676  hypothetical protein  47.27 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1466  hypothetical protein  27.7 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000199339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0659  hypothetical protein  24.84 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1971  hypothetical protein  36.76 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0041  protein of unknown function DUF1706  23.08 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1160  hypothetical protein  21.69 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1001  hypothetical protein  24.28 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0404  protein of unknown function DUF1706  22.94 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.408564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>