23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2145 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2145  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2485  protein of unknown function DUF1706  85.71 
 
 		 168 aa  285  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1110  hypothetical protein  49.7 
 
 		 172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2524  hypothetical protein  46.99 
 
 		 171 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.551325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1462  hypothetical protein  44.58 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1764  hypothetical protein  45.18 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0636  hypothetical protein  29.14 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1131  hypothetical protein  28.98 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0272678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1899  hypothetical protein  28.74 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2111  hypothetical protein  30.47 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1363  protein of unknown function DUF1706  25.57 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0980  hypothetical protein  25.14 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0763  hypothetical protein  26.06 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1974  hypothetical protein  44.64 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0676  hypothetical protein  44.64 
 
 		 64 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1466  hypothetical protein  28.38 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000199339  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1971  hypothetical protein  40.91 
 
 		 71 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1160  hypothetical protein  21.08 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0659  hypothetical protein  23.57 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0404  protein of unknown function DUF1706  25.21 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.408564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0041  protein of unknown function DUF1706  20.98 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1001  hypothetical protein  22.09 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0136  protein of unknown function DUF1706  20.47 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.710471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>