15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0668 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0450    100 
 
 		 438 bp  868    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0668    100 
 
 		 438 bp  868    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0029    81.97 
 
 		 354 bp  218  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  81.03 
 
 		 396 bp  186  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010487  EcSMS35_D0002    80 
 
 		 396 bp  155  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4080    80 
 
 		 377 bp  127  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1300    83.22 
 
 		 438 bp  93.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2232  IS1 transposase  88.24 
 
 		 321 bp  89.7  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0080    83.93 
 
 		 324 bp  79.8  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4422    81.03 
 
 		 315 bp  75.8  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0050    80.89 
 
 		 177 bp  73.8  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0128    85.57 
 
 		 123 bp  73.8  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3838  IS1 transposase  80.62 
 
 		 276 bp  71.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3174    96.55 
 
 		 177 bp  50.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.479907  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0085    96.55 
 
 		 276 bp  50.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000406972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>