9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3174 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3174    100 
 
 		 177 bp  351  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.479907  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0050    93.06 
 
 		 177 bp  248  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0085    92.37 
 
 		 276 bp  172  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000406972  n/a   
 
 
-
 
NC_010487  EcSMS35_D0002    81.53 
 
 		 396 bp  81.8  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  82.81 
 
 		 396 bp  79.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0080    84.21 
 
 		 324 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0029    82.61 
 
 		 354 bp  56  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0450    96.55 
 
 		 438 bp  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0668    96.55 
 
 		 438 bp  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>