13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0029 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0029    100 
 
 		 354 bp  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0450    81.97 
 
 		 438 bp  218  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0668    81.97 
 
 		 438 bp  218  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4422    89.22 
 
 		 315 bp  115  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  83.64 
 
 		 396 bp  113  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010487  EcSMS35_D0002    83.64 
 
 		 396 bp  113  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4080    88.24 
 
 		 377 bp  107  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0080    82.42 
 
 		 324 bp  97.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3838  IS1 transposase  86.59 
 
 		 276 bp  75.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0050    81.9 
 
 		 177 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3174    82.61 
 
 		 177 bp  56  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.479907  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0085    85.94 
 
 		 276 bp  56  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000406972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2232  IS1 transposase  93.55 
 
 		 321 bp  46.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>