10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4080 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_4080    100 
 
 		 377 bp  747    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4422    96.92 
 
 		 315 bp  339  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0450    80 
 
 		 438 bp  127  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0668    80 
 
 		 438 bp  127  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0029    88.24 
 
 		 354 bp  107  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  88 
 
 		 396 bp  103  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0080    87.1 
 
 		 324 bp  89.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_010487  EcSMS35_D0002    85.11 
 
 		 396 bp  75.8  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0050    81.19 
 
 		 177 bp  50.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1300    79.84 
 
 		 438 bp  48.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>