11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0050 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0050    100 
 
 		 177 bp  351  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3174    93.06 
 
 		 177 bp  248  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.479907  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0085    96.95 
 
 		 276 bp  220  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000406972  n/a   
 
 
-
 
NC_010487  EcSMS35_D0002    83.43 
 
 		 396 bp  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  82.86 
 
 		 396 bp  109  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0128    96.72 
 
 		 123 bp  97.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0080    83.61 
 
 		 324 bp  83.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0450    80.89 
 
 		 438 bp  73.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0668    80.89 
 
 		 438 bp  73.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0029    81.9 
 
 		 354 bp  58  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4080    81.19 
 
 		 377 bp  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>