12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_D0002 on replicon NC_010487
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  96.2 
 
 		 396 bp  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010487  EcSMS35_D0002    100 
 
 		 396 bp  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0080    95.68 
 
 		 324 bp  303  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0450    80 
 
 		 438 bp  155  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0668    80 
 
 		 438 bp  155  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0050    83.43 
 
 		 177 bp  117  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0029    83.64 
 
 		 354 bp  113  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3174    81.53 
 
 		 177 bp  81.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.479907  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0085    85.71 
 
 		 276 bp  77.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000406972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4080    85.11 
 
 		 377 bp  75.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2232  IS1 transposase  88.89 
 
 		 321 bp  69.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0128    82.02 
 
 		 123 bp  50.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>