More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2232 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2232  IS1 transposase  100 
 
 
106 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  61.7 
 
 
131 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3838  IS1 transposase  62 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0165  insertion sequence protein  38.1 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000498259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0741  IS1 family transposase orfB  38.1 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  30.85 
 
 
167 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2841  IS1 transposase orfB  30.85 
 
 
125 aa  50.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  30.85 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  30.85 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04125  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03179  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04173  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02478  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02772  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01982  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02231  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02607  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01124  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03435  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04142  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.972616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00216  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01998  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01921  hypothetical protein  29.79 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3833  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3817  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1074  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3306  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3231  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2454  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.583407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4117  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00102358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1548  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0949  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0561659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4298  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4780  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0623  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3196  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1988  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.151286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4216  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1943  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1875  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000296031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4283  IS1 transposase  29.79 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4275  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3919  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4527  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4600  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4260  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0285  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2913  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0434  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0457  IS1 transposase orfB  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>