More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0741 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0741  IS1 family transposase orfB  100 
 
 
122 aa  253  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0165  insertion sequence protein  97.46 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000498259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1626  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1319  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.808236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0909  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00244451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2683  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.393271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1900  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2922  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3236  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3597  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.169674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  50 
 
 
232 aa  123  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2814  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4874  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0964  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1722  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2649  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1981  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3942  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2090  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2010  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2054  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3362  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3916  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.753091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04173  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01124  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01982  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01998  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02607  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02772  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04142  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.972616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03435  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04125  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1222  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.143606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4825  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2841  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4585  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.398823  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  49.17 
 
 
232 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00216  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02231  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03179  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02478  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0862  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.537368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  49.17 
 
 
232 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  49.17 
 
 
232 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  49.17 
 
 
232 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  49.17 
 
 
232 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  49.17 
 
 
232 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  49.17 
 
 
232 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1074  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0557  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4757  IS1 transposase orfB  50 
 
 
167 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.279139  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1548  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0285  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0434  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0457  IS1 transposase orfB  49.17 
 
 
125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>