76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3502 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3502  RC150  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2990  phospholipase/Carboxylesterase  50.26 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.998275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4692  phospholipase/carboxylesterase  49.75 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.524957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3330  phospholipase/carboxylesterase  48 
 
 		 201 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3239  phospholipase/Carboxylesterase  48.24 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3099  hypothetical protein  48.19 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.010665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0604  phospholipase/Carboxylesterase  41.27 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.417113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1281  phospholipase/Carboxylesterase  41.27 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5284  phospholipase/Carboxylesterase  42.33 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4934  phospholipase/carboxylesterase  46.15 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035929 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3054  hypothetical protein  41.21 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3781  phospholipase/carboxylesterase  41.3 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.715123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1566  carboxylesterase  38.71 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.59576  normal  0.516185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3653  phospholipase/carboxylesterase family protein  38.3 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3433  phospholipase/carboxylesterase family protein  38.3 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3703  phospholipase/carboxylesterase family protein  38.3 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3394  phospholipase/carboxylesterase family protein  38.3 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.466403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1054  phospholipase/carboxylesterase  42.02 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.664928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3750  carboxylesterase  37.77 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3671  phospholipase/carboxylesterase family protein  38.3 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3675  phospholipase/carboxylesterase family protein  38.3 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.420577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3345  phospholipase/carboxylesterase family protein  38.76 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2154  phospholipase/carboxylesterase  38.78 
 
 		 209 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2431  phospholipase/Carboxylesterase  38.78 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0366  phospholipase/carboxylesterase family protein  35.18 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34870  predicted esterase  35.98 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3329  phospholipase/carboxylesterase  38.2 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0264  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  44.25 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.368898  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2211  phospholipase/Carboxylesterase  42.55 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000781907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7203  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  40.74 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3092  phospholipase/carboxylesterase  42.7 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0944125  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2541  phospholipase/carboxylesterase  35.56 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2593  phospholipase/carboxylesterase  35.56 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2114  phospholipase/Carboxylesterase  37.81 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3749  phospholipase/carboxylesterase  39.2 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4199  phospholipase/carboxylesterase  36.87 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5943  hypothetical protein  38.34 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0331  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 		 509 aa  92  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0282  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.63 
 
 		 518 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0313  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.63 
 
 		 518 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1711  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  32.8 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0073  esterase  29.44 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1369  hypothetical protein  27.98 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2868  hypothetical protein  32.46 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.308795  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0989  hypothetical protein  31.09 
 
 		 288 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0931  esterase/lipase/thioesterase, active site  31.09 
 
 		 288 aa  74.7  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0423  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.15 
 
 		 517 aa  71.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  31.69 
 
 		 381 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2402  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.0303662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  27.87 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  30.33 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  23.66 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  23.12 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  27.72 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  31.33 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1578  phospholipase/Carboxylesterase  25.36 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  28.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  28.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  28.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  28.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  28.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  25.84 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  28.91 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  28.99 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  25.7 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  23.71 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  25.67 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84806  alcohol acyl transferase  31.31 
 
 		 427 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  25.36 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  31.78 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2100  phospholipase/Carboxylesterase  24.06 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  25.5 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1614  phospholipase/carboxylesterase  24.06 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  38.24 
 
 		 332 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  24.62 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1788  hydrolase or acyltransferase  26.77 
 
 		 258 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000680312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>