128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3054 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3781  phospholipase/carboxylesterase  98.04 
 
 		 205 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.715123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5284  phospholipase/Carboxylesterase  70.94 
 
 		 202 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2431  phospholipase/Carboxylesterase  70.65 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3749  phospholipase/carboxylesterase  70.2 
 
 		 213 aa  261  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4934  phospholipase/carboxylesterase  69.31 
 
 		 210 aa  261  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2154  phospholipase/carboxylesterase  69.65 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2114  phospholipase/Carboxylesterase  66.5 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3092  phospholipase/carboxylesterase  71.08 
 
 		 202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0944125  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7203  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  64.18 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5943  hypothetical protein  63.13 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1054  phospholipase/carboxylesterase  55.34 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.664928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4199  phospholipase/carboxylesterase  52.5 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1281  phospholipase/Carboxylesterase  53.54 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3750  carboxylesterase  46.15 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0604  phospholipase/Carboxylesterase  49.75 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.417113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1566  carboxylesterase  45.64 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.59576  normal  0.516185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3345  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.13 
 
 		 203 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3433  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.13 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3394  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.13 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.466403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3703  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.13 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3653  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.13 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3671  phospholipase/carboxylesterase family protein  46.15 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3675  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.64 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.420577  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0366  phospholipase/carboxylesterase family protein  43.59 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1711  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  44.56 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3329  phospholipase/carboxylesterase  43.59 
 
 		 205 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34870  predicted esterase  46.04 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2211  phospholipase/Carboxylesterase  50.51 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000781907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3099  hypothetical protein  42.5 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.010665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0264  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  47.55 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.368898  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4692  phospholipase/carboxylesterase  38.42 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.524957 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3502  RC150  41.21 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2990  phospholipase/Carboxylesterase  38.3 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.998275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3239  phospholipase/Carboxylesterase  38.83 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0282  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.95 
 
 		 518 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0313  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.95 
 
 		 518 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2541  phospholipase/carboxylesterase  41.58 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2593  phospholipase/carboxylesterase  41.58 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0423  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.27 
 
 		 517 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0331  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.21 
 
 		 509 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3330  phospholipase/carboxylesterase  37.95 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2868  hypothetical protein  34.17 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.308795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1369  hypothetical protein  32.84 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0931  esterase/lipase/thioesterase, active site  33.17 
 
 		 288 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2402  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.7 
 
 		 518 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.0303662 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0989  hypothetical protein  33.17 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0073  esterase  29.63 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  34.13 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  32.42 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  32.37 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  34.98 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  34.01 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  26.44 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  29.38 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  27.49 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  25.93 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  25.76 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  25.65 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0572  phospholipase/Carboxylesterase  35.96 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  28.11 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2100  phospholipase/Carboxylesterase  30.66 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  32.52 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  26.56 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1614  phospholipase/carboxylesterase  30.19 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0540  phospholipase/carboxylesterase  35.94 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0982945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  33.83 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  24.65 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  23.25 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  28.37 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  25.96 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  23.47 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  29.56 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  27.8 
 
 		 319 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  29.15 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  30.35 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  30.15 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  34.81 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2495  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  normal  0.915999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2128  phospholipase/carboxylesterase  30.5 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282469  hitchhiker  0.000267211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  26.29 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  29.17 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  26.8 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  26.11 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  30.88 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  27.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.61 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  29.29 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0090  putative esterase  31.21 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  27.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  27.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  27.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  27.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  27.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  27.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  31.22 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2058  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.25 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  23.7 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  30.5 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>