67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2868 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2868  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.308795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1711  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  36.97 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3054  hypothetical protein  34.17 
 
 
205 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3781  phospholipase/carboxylesterase  34.17 
 
 
205 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.715123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5284  phospholipase/Carboxylesterase  34.55 
 
 
202 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4934  phospholipase/carboxylesterase  32.16 
 
 
210 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2431  phospholipase/Carboxylesterase  32.98 
 
 
209 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2154  phospholipase/carboxylesterase  32.45 
 
 
209 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2114  phospholipase/Carboxylesterase  33.51 
 
 
224 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3749  phospholipase/carboxylesterase  31.61 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7203  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  33.7 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3092  phospholipase/carboxylesterase  35.33 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0944125  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0282  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.2 
 
 
518 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0313  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.2 
 
 
518 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5943  hypothetical protein  29.03 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0989  hypothetical protein  29.19 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0931  esterase/lipase/thioesterase, active site  29.19 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3345  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.16 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1369  hypothetical protein  28.23 
 
 
292 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3502  RC150  32.46 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0366  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.11 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1281  phospholipase/Carboxylesterase  28.16 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4692  phospholipase/carboxylesterase  28.65 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.524957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0331  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.44 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3329  phospholipase/carboxylesterase  25.89 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0423  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.35 
 
 
517 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3394  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.59 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.466403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3703  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.29 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3653  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.29 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4199  phospholipase/carboxylesterase  27.23 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3433  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.29 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1566  carboxylesterase  26.44 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.59576  normal  0.516185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0604  phospholipase/Carboxylesterase  26.56 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.417113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3750  carboxylesterase  26.44 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0264  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  28.93 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.368898  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3675  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.67 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.420577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3671  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.97 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34870  predicted esterase  25.49 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1054  phospholipase/carboxylesterase  27.45 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.664928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2990  phospholipase/Carboxylesterase  27.91 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.998275  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3330  phospholipase/carboxylesterase  26.98 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3239  phospholipase/Carboxylesterase  27.27 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3099  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2402  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
518 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.0303662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  28.44 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  29.65 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2211  phospholipase/Carboxylesterase  27.42 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000781907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  25.77 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  28.12 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  26.29 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0073  esterase  29.9 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  30.94 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2593  phospholipase/carboxylesterase  24.18 
 
 
197 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2541  phospholipase/carboxylesterase  24.18 
 
 
197 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  27.94 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  27.45 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  28.86 
 
 
381 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  27.98 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  26.84 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  24.6 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  23.88 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  25.24 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  23.96 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  27.04 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  29.65 
 
 
218 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>