59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2788 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2788  protein of unknown function DUF900, hydrolase family protein  100 
 
 		 357 aa  700    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0188  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  38.76 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277973  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2852  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  36.9 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0746757  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2445  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  36.54 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0694595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3189  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  35.1 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0599961  normal  0.155338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2425  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.83 
 
 		 394 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1990  protein of unknown function DUF900, hydrolase family protein  35.21 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.972188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5090  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  37.59 
 
 		 393 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102585 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4919  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  38.49 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0646  putative lipoprotein  33.99 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193127  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5370  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  36.91 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0644  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  34.83 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0328  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.221283  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0425  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  35.17 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0517  hypothetical protein  33.53 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4880  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  33.93 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4254  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  35.61 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0816597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1307  hypothetical protein  35.54 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3785  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.33 
 
 		 422 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4050  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  31.67 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5143  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  33.44 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2400  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  32.33 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0115  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  33.87 
 
 		 425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6957  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  32.68 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0105  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  33.78 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5104  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  31.05 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4413  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  32.58 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1657  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.03 
 
 		 408 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.0238523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0885  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  35.17 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.451232  normal  0.150785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1041  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.27 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0813673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1075  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  38.6 
 
 		 415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3042  hypothetical protein  37.2 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.747942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7357  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.94 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581401  normal  0.167837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1569  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  31.65 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.781452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1085  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  39.63 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0472  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  30.89 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000004024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3233  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  31.05 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3479  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  31.16 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.216435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0375  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.9 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2113  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  36.9 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00719162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0299  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.9 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0343  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  34.9 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1468  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  30.04 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  25.44 
 
 		 661 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0519  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  30.69 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0827  hypothetical protein  33.51 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1977  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  29.08 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2534  protein of unknown function DUF900, hydrolase family protein  28.29 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0983031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3550  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  29.2 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.02305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1831  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  35.33 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0643  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like protein  33.33 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.399465  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0234  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  31.76 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.984696  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0058  protein of unknown function DUF900, hydrolase family protein  28.29 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0679  hypothetical protein  32.33 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000679307  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3209  hypothetical protein  26.87 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4188  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  22.16 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.90269  normal  0.255036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28.1 
 
 		 3586 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3923  hypothetical protein  27.05 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2412  hypothetical protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>