17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1728 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1728  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0233  hypothetical protein  38.27 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2873  hypothetical protein  40.51 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00127116  hitchhiker  0.00000294774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1100  hypothetical protein  45.57 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3766  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000350309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  37.97 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  37.97 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0640  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2447  hypothetical protein  37.97 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000303308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1441  hypothetical protein  41.38 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000203609  normal  0.0265644 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0903  hypothetical protein  38.89 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00881277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  25.71 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2981  hypothetical protein  24.68 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2659  hypothetical protein  23.38 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.072724  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0828  hypothetical protein  23.88 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0332453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3247  hypothetical protein  31.75 
 
 		 181 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  23.19 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>