17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2873 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2873  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00127116  hitchhiker  0.00000294774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3766  hypothetical protein  63.86 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000350309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0640  hypothetical protein  68.67 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  63.1 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  60.71 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2447  hypothetical protein  50.62 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000303308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1100  hypothetical protein  49.4 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1728  hypothetical protein  40.51 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0233  hypothetical protein  42.11 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  29.82 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0305  hypothetical protein  34.52 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000105249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1402  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2981  hypothetical protein  25 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  26.42 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2659  hypothetical protein  25 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.072724  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0828  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0332453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>