16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1100 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1100  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2447  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  90.5  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000303308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  54.22 
 
 
87 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  54.22 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2873  hypothetical protein  49.4 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00127116  hitchhiker  0.00000294774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0640  hypothetical protein  50.67 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3766  hypothetical protein  47.5 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000350309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1728  hypothetical protein  45.57 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0233  hypothetical protein  40.96 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0305  hypothetical protein  31.58 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000105249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2659  hypothetical protein  27.38 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.072724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1131  hypothetical protein  32 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  35.71 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2981  hypothetical protein  26.19 
 
 
77 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0903  hypothetical protein  35.38 
 
 
220 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00881277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>