16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3434 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  94.25 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2873  hypothetical protein  63.1 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00127116  hitchhiker  0.00000294774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3766  hypothetical protein  61.45 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000350309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0640  hypothetical protein  55.42 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2447  hypothetical protein  51.76 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000303308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1100  hypothetical protein  54.22 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0305  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000105249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0233  hypothetical protein  38.75 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1728  hypothetical protein  37.97 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.072724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  30.65 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1490  hypothetical protein  32.39 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2374  hypothetical protein  42.55 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  29.27 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>