17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3496 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  174  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  94.25 
 
 
87 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3766  hypothetical protein  60.24 
 
 
86 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000350309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2873  hypothetical protein  60.71 
 
 
84 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00127116  hitchhiker  0.00000294774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0640  hypothetical protein  55.42 
 
 
84 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2447  hypothetical protein  51.76 
 
 
95 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000303308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1100  hypothetical protein  54.22 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0305  hypothetical protein  33.75 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000105249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1728  hypothetical protein  37.97 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0233  hypothetical protein  36.78 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2981  hypothetical protein  27.27 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2659  hypothetical protein  29.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.072724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  31.67 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1490  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2374  hypothetical protein  42.55 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1131  hypothetical protein  34 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  28.57 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>