16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3766 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3766  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000350309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2873  hypothetical protein  63.86 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00127116  hitchhiker  0.00000294774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  61.45 
 
 
87 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  60.24 
 
 
87 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0640  hypothetical protein  55.42 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2447  hypothetical protein  52.5 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000303308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1100  hypothetical protein  47.5 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1728  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0233  hypothetical protein  37.66 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0305  hypothetical protein  33.73 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000105249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2374  hypothetical protein  39.34 
 
 
89 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  32.2 
 
 
71 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2981  hypothetical protein  28.57 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2659  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.072724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1131  hypothetical protein  38 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  24.29 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>