16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0640 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0640  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2873  hypothetical protein  68.67 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00127116  hitchhiker  0.00000294774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3766  hypothetical protein  55.42 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000350309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  55.42 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  55.42 
 
 
87 aa  90.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1100  hypothetical protein  50.67 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2447  hypothetical protein  55.07 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000303308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0233  hypothetical protein  37.35 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1728  hypothetical protein  39.19 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  26.56 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0305  hypothetical protein  43.75 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000105249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  29.41 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0828  hypothetical protein  26.83 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0332453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2374  hypothetical protein  31.51 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1402  hypothetical protein  36.67 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1131  hypothetical protein  43.18 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>