21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1061 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1061  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  303  7e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.166141 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0948  hypothetical protein  66.19 
 
 
146 aa  209  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0468822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1337  flavin reductase domain-containing protein  70.07 
 
 
146 aa  192  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0826  flavin reductase domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  184  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.151292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  26.23 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  32.17 
 
 
248 aa  47.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.4 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0723  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  26.98 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.44 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.77 
 
 
311 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.5 
 
 
195 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.98 
 
 
311 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  26.52 
 
 
226 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  26.52 
 
 
226 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  26.52 
 
 
226 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.77 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  26.23 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.91 
 
 
190 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  26.23 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  30.23 
 
 
305 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>