32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0919 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0919  50S ribosomal protein L37Ae  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1939  50S ribosomal protein L37Ae  89.11 
 
 		 108 aa  191  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1379  50S ribosomal protein L37Ae  83.17 
 
 		 101 aa  181  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.28633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0834  50S ribosomal protein L37Ae  81.19 
 
 		 101 aa  179  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0772852 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1601  50S ribosomal protein L37Ae  77.45 
 
 		 106 aa  171  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0491  50S ribosomal protein L37Ae  52.94 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0704  50S ribosomal protein L37Ae  42.39 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1251  50S ribosomal protein L37Ae  42.39 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1424  50S ribosomal protein L37Ae  42.39 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0179  50S ribosomal protein L37Ae  44.57 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1262  50S ribosomal protein L37Ae  42.39 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0201  50S ribosomal protein L37Ae  44.05 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.545007  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1820  ribosomal protein L37a  50.72 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0014  ribosomal protein L37a  47.95 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.500236  normal  0.661886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2508  50S ribosomal protein L37Ae  46.67 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0318986  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1676  ribosomal protein L37a  49.28 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1339  50S ribosomal protein L37AE  45.98 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.165367  hitchhiker  0.0048935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2672  50S ribosomal protein L37Ae  40.66 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2524  Ribosomal L37ae protein  50.72 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.392766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1360  50S ribosomal protein L37Ae  40 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.935606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2284  ribosomal protein L37a  46.38 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1790  Ribosomal L37ae protein  46.27 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0384183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0079  50S ribosomal protein L37Ae  46.03 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0714054  hitchhiker  0.000985782 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04930  60s ribosomal protein l37a, putative  39.47 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893912  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60156  predicted protein  41.56 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0180  ribosomal protein L37a  44.29 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.196594  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47804  predicted protein  40.79 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13231  Ribosomal protein L37a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.71 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.858594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1481  Ribosomal L37ae protein  39.73 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2453  Ribosomal L37ae protein  39.73 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0564  Ribosomal L37ae protein  35.8 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0434  hypothetical protein  46.43 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00552485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>