35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0079 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0079  50S ribosomal protein L37Ae  100 
 
 		 72 aa  146  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0714054  hitchhiker  0.000985782 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1790  Ribosomal L37ae protein  76.12 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0384183  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0491  50S ribosomal protein L37Ae  54.84 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0180  ribosomal protein L37a  50 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.196594  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0919  50S ribosomal protein L37Ae  46.03 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1601  50S ribosomal protein L37Ae  46.77 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1379  50S ribosomal protein L37Ae  47.62 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.28633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0834  50S ribosomal protein L37Ae  46.03 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0772852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1939  50S ribosomal protein L37Ae  44.44 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1339  50S ribosomal protein L37AE  49.21 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.165367  hitchhiker  0.0048935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1820  ribosomal protein L37a  49.21 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0201  50S ribosomal protein L37Ae  45.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.545007  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1251  50S ribosomal protein L37Ae  44.44 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0704  50S ribosomal protein L37Ae  44.44 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1676  ribosomal protein L37a  44.44 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2284  ribosomal protein L37a  47.54 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2508  50S ribosomal protein L37Ae  47.69 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0318986  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0014  ribosomal protein L37a  44.44 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.500236  normal  0.661886 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1424  50S ribosomal protein L37Ae  44.44 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2524  Ribosomal L37ae protein  47.62 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.392766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1360  50S ribosomal protein L37Ae  41.79 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.935606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1262  50S ribosomal protein L37Ae  44.44 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0179  50S ribosomal protein L37Ae  49.21 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2672  50S ribosomal protein L37Ae  42.86 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60156  predicted protein  46.97 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04930  60s ribosomal protein l37a, putative  40.32 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893912  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0434  hypothetical protein  47.46 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00552485 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47804  predicted protein  42.42 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13231  Ribosomal protein L37a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.06 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.858594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1481  Ribosomal L37ae protein  34.72 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2453  Ribosomal L37ae protein  36.51 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1582  transposase, IS605 OrfB  43.18 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0479123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1730  transposase, IS605 OrfB  43.18 
 
 		 443 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.255764  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0564  Ribosomal L37ae protein  33.82 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0889  transposase, IS605 OrfB  43.18 
 
 		 440 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>