30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1481 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1481  Ribosomal L37ae protein  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2453  Ribosomal L37ae protein  91.86 
 
 
87 aa  159  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0564  Ribosomal L37ae protein  77.38 
 
 
88 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0014  ribosomal protein L37a  66.67 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.500236  normal  0.661886 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2672  50S ribosomal protein L37Ae  59.04 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0201  50S ribosomal protein L37Ae  46.07 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.545007  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1820  ribosomal protein L37a  50 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1676  ribosomal protein L37a  46.99 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2508  50S ribosomal protein L37Ae  44.05 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0318986  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2524  Ribosomal L37ae protein  45.98 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.392766  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1339  50S ribosomal protein L37AE  47.5 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.165367  hitchhiker  0.0048935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1424  50S ribosomal protein L37Ae  40.91 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0704  50S ribosomal protein L37Ae  40.91 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1251  50S ribosomal protein L37Ae  40.91 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2284  ribosomal protein L37a  43.68 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1262  50S ribosomal protein L37Ae  39.77 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1360  50S ribosomal protein L37Ae  42.68 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.935606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0491  50S ribosomal protein L37Ae  45.95 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0179  50S ribosomal protein L37Ae  43.18 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1601  50S ribosomal protein L37Ae  41.1 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0919  50S ribosomal protein L37Ae  39.73 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1379  50S ribosomal protein L37Ae  36.36 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.28633  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0834  50S ribosomal protein L37Ae  36.99 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0772852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1939  50S ribosomal protein L37Ae  36.99 
 
 
108 aa  52  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0180  ribosomal protein L37a  41.1 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.196594  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47804  predicted protein  34.21 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60156  predicted protein  36.71 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04930  60s ribosomal protein l37a, putative  34.62 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893912  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0079  50S ribosomal protein L37Ae  34.72 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0714054  hitchhiker  0.000985782 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1790  Ribosomal L37ae protein  35.94 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0384183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>