32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04930 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04930  60s ribosomal protein l37a, putative  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893912  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13231  Ribosomal protein L37a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  65.93 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.858594  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60156  predicted protein  65.56 
 
 
91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47804  predicted protein  65.17 
 
 
94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2284  ribosomal protein L37a  42.86 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0704  50S ribosomal protein L37Ae  41.67 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1251  50S ribosomal protein L37Ae  41.67 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1424  50S ribosomal protein L37Ae  41.67 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0180  ribosomal protein L37a  47.14 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.196594  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1262  50S ribosomal protein L37Ae  41.67 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1676  ribosomal protein L37a  41.03 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0179  50S ribosomal protein L37Ae  45.24 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1339  50S ribosomal protein L37AE  46.67 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.165367  hitchhiker  0.0048935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0491  50S ribosomal protein L37Ae  45.71 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0201  50S ribosomal protein L37Ae  41.25 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.545007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0014  ribosomal protein L37a  39.29 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.500236  normal  0.661886 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1820  ribosomal protein L37a  40.48 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0834  50S ribosomal protein L37Ae  40.7 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0772852 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1601  50S ribosomal protein L37Ae  43.94 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2524  Ribosomal L37ae protein  41.25 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.392766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2672  50S ribosomal protein L37Ae  32.5 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0919  50S ribosomal protein L37Ae  39.47 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1379  50S ribosomal protein L37Ae  40.3 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.28633  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1360  50S ribosomal protein L37Ae  36.78 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.935606  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1939  50S ribosomal protein L37Ae  38.81 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2508  50S ribosomal protein L37Ae  36.25 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0318986  normal  0.342321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1790  Ribosomal L37ae protein  42.65 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0384183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0079  50S ribosomal protein L37Ae  40.32 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0714054  hitchhiker  0.000985782 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0434  hypothetical protein  41.07 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00552485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0564  Ribosomal L37ae protein  34.94 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2453  Ribosomal L37ae protein  35.44 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1481  Ribosomal L37ae protein  34.62 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>