32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0201 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0201  50S ribosomal protein L37Ae  100 
 
 
95 aa  190  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.545007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2508  50S ribosomal protein L37Ae  76.09 
 
 
94 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0318986  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1360  50S ribosomal protein L37Ae  58.06 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.935606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1339  50S ribosomal protein L37AE  56.47 
 
 
94 aa  99  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.165367  hitchhiker  0.0048935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2524  Ribosomal L37ae protein  50 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.392766  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2284  ribosomal protein L37a  52.13 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1676  ribosomal protein L37a  45.65 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1820  ribosomal protein L37a  50 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0014  ribosomal protein L37a  50.53 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.500236  normal  0.661886 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2672  50S ribosomal protein L37Ae  49.35 
 
 
94 aa  89.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1601  50S ribosomal protein L37Ae  47.5 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0704  50S ribosomal protein L37Ae  48.75 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1251  50S ribosomal protein L37Ae  48.75 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0491  50S ribosomal protein L37Ae  56.76 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1424  50S ribosomal protein L37Ae  47.5 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1262  50S ribosomal protein L37Ae  47.5 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0564  Ribosomal L37ae protein  50 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0919  50S ribosomal protein L37Ae  44.05 
 
 
102 aa  77  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0834  50S ribosomal protein L37Ae  45 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0772852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1939  50S ribosomal protein L37Ae  43.75 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1481  Ribosomal L37ae protein  46.07 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1379  50S ribosomal protein L37Ae  43.75 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.28633  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2453  Ribosomal L37ae protein  47.62 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0179  50S ribosomal protein L37Ae  48.75 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04930  60s ribosomal protein l37a, putative  41.25 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893912  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60156  predicted protein  40 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0180  ribosomal protein L37a  48 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.196594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0079  50S ribosomal protein L37Ae  45.59 
 
 
72 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0714054  hitchhiker  0.000985782 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47804  predicted protein  42.65 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13231  Ribosomal protein L37a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.858594  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1790  Ribosomal L37ae protein  42.65 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0384183  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0434  hypothetical protein  35.71 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00552485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>