32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2508 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2508  50S ribosomal protein L37Ae  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0318986  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0201  50S ribosomal protein L37Ae  76.09 
 
 		 95 aa  149  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.545007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1360  50S ribosomal protein L37Ae  60.92 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.935606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1339  50S ribosomal protein L37AE  51.16 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.165367  hitchhiker  0.0048935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2284  ribosomal protein L37a  52.63 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0014  ribosomal protein L37a  52.44 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.500236  normal  0.661886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1676  ribosomal protein L37a  48.28 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2524  Ribosomal L37ae protein  51.85 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.392766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1820  ribosomal protein L37a  51.19 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2672  50S ribosomal protein L37Ae  49.33 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0704  50S ribosomal protein L37Ae  46.91 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1251  50S ribosomal protein L37Ae  46.91 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1424  50S ribosomal protein L37Ae  46.91 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1262  50S ribosomal protein L37Ae  46.91 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0491  50S ribosomal protein L37Ae  53.33 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0564  Ribosomal L37ae protein  48.78 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0919  50S ribosomal protein L37Ae  46.67 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1481  Ribosomal L37ae protein  44.05 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1601  50S ribosomal protein L37Ae  48 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2453  Ribosomal L37ae protein  44.05 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0834  50S ribosomal protein L37Ae  45.33 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0772852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1939  50S ribosomal protein L37Ae  44 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1379  50S ribosomal protein L37Ae  41.86 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.28633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0179  50S ribosomal protein L37Ae  46.91 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0180  ribosomal protein L37a  46.67 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.196594  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60156  predicted protein  38.27 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0079  50S ribosomal protein L37Ae  47.69 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0714054  hitchhiker  0.000985782 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04930  60s ribosomal protein l37a, putative  36.25 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893912  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1790  Ribosomal L37ae protein  40.58 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0384183  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47804  predicted protein  36.76 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13231  Ribosomal protein L37a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.48 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.858594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0434  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00552485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>