275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1984 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1984  ISCps7, transposase  100 
 
 
100 aa  199  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  95.12 
 
 
318 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  95.12 
 
 
318 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  95.12 
 
 
318 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  95.12 
 
 
318 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  95.12 
 
 
318 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  95.12 
 
 
318 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1384  transposase IS116/IS110/IS902  93.9 
 
 
213 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  81.52 
 
 
318 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  81.52 
 
 
318 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  81.52 
 
 
318 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02575  hypothetical protein  74.7 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  76.83 
 
 
323 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  73.17 
 
 
317 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.06 
 
 
322 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.93 
 
 
322 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0067  IS110 family transposase  55.95 
 
 
323 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0110214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  56.25 
 
 
318 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
318 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2961  hypothetical protein  57.89 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.720618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
320 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
320 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
320 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
320 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
320 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
320 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 
320 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 
320 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 
320 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 
320 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 
320 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 
320 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0654  transposase IS116/IS110/IS902  49.38 
 
 
328 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3340  transposase IS116/IS110/IS902  49.38 
 
 
328 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.44 
 
 
314 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.44 
 
 
314 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.44 
 
 
314 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
321 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.44 
 
 
314 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
321 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
321 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
321 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0634  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1115  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840923  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1394  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1512  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1946  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0175494  decreased coverage  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2020  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00925904  normal  0.0355962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2502  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  0.030374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2605  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.978061  normal  0.958241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3229  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4264  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
316 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
321 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0292  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0974  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.67 
 
 
284 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074599  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0348953  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3185  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.497846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4477  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.59 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0479  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.89 
 
 
304 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5616  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3822  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.22 
 
 
316 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2763  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
316 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0660856  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.22 
 
 
316 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0668  transposase IS110 family protein  49.38 
 
 
315 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.732525  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0821  transposase IS110 family protein  49.38 
 
 
315 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450951  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.84 
 
 
316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.84 
 
 
316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.84 
 
 
316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.84 
 
 
316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.84 
 
 
316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.84 
 
 
316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2339  transposase IS110 family protein  49.38 
 
 
315 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.354991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2316  transposase IS110 family protein  49.38 
 
 
315 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367866  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 
321 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 
321 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 
321 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 
321 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 
321 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 
321 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 
321 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 
321 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.38 
 
 
315 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.24 
 
 
316 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.38 
 
 
315 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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