16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04746 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04746  stas domain, putative  100 
 
 		 109 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0900  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3797  anti-sigma-factor antagonist  42.22 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1141  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.51 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3295  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  44.87 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1316  anti-sigma-factor antagonist  39.56 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2995  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1534  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0787  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.97 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0147  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.817558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0914  STAS domain protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0632  anti-sigma-factor antagonist  39.68 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0277  CheX protein  35.14 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255242  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.22 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2319  anti-anti-sigma factor, putative  35.79 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>