15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0900 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0900  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3797  anti-sigma-factor antagonist  62.63 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1141  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  49.44 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3295  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.84 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04746  stas domain, putative  50 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0787  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.76 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0914  STAS domain protein  39.56 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1316  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2319  anti-anti-sigma factor, putative  37.65 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1534  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1740  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.93 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000969035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>