108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02560 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01111  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01568  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02212  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02426  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02786  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04734  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04847  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05742  ISXoo13 transposase  99.06 
 
 
411 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02560  transposase  100 
 
 
106 aa  220  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01375  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01504  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01758  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.339943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02978  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04079  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04311  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05630  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06103  ISXoo13 transposase  98.11 
 
 
411 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.600961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04142  ISXoo13 transposase  97.17 
 
 
411 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.58 
 
 
408 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.495823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1226  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.58 
 
 
408 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.58 
 
 
408 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90501  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2148  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.58 
 
 
408 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493226  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2200  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.58 
 
 
408 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240905  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7486  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  68.63 
 
 
407 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0254  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.3 
 
 
406 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0652  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.3 
 
 
406 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0716  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.3 
 
 
406 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0872  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.3 
 
 
406 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.3 
 
 
406 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1664  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.3 
 
 
406 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2270  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.3 
 
 
406 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.67 
 
 
417 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0697  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.29 
 
 
413 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2612  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.29 
 
 
413 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0107  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0319  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0561  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1380  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1538  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2266  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2284  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2326  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00136305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2879  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3181  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4134  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.1 
 
 
413 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00235401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  37.97 
 
 
411 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  37.97 
 
 
411 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  37.97 
 
 
411 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0832  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.108641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1063  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1507  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1918  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1981  transposase  36.71 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2462  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.25 
 
 
411 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.87 
 
 
421 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.59 
 
 
411 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.31 
 
 
441 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 
441 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 
441 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 
441 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  32.32 
 
 
440 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5539  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  35.44 
 
 
407 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.704796 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.85 
 
 
408 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.72 
 
 
431 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.91 
 
 
407 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.91 
 
 
407 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.91 
 
 
407 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5329  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.91 
 
 
407 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.21 
 
 
413 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2101  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.21 
 
 
413 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135516  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
406 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.89 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.89 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  31.58 
 
 
406 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  31.58 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
411 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.77 
 
 
411 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0520  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.11 
 
 
417 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0847  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.11 
 
 
417 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1105  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.11 
 
 
417 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2843  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.11 
 
 
417 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0081  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0229  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013108  unclonable  1.0640799999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0900  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1002  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.692559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1333  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.38515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1398  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.488423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1978  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00748461  normal  0.0175211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2160  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2484  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.23891  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3003  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3481  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>