32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00517 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00517  transposase  100 
 
 		 115 aa  242  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  87.84 
 
 		 323 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  84 
 
 		 323 aa  140  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  85.14 
 
 		 323 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  82.43 
 
 		 238 aa  137  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  81.08 
 
 		 323 aa  133  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0408  transposase  73.91 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  56 
 
 		 321 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  56.76 
 
 		 463 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  56.76 
 
 		 321 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  56.76 
 
 		 333 aa  96.7  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2834  hypothetical protein  76.67 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  61.9 
 
 		 229 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  52.78 
 
 		 325 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  52.78 
 
 		 325 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4133  transposase  54.44 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261032  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  52 
 
 		 333 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  50.67 
 
 		 327 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  51.35 
 
 		 325 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  50.67 
 
 		 497 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  51.35 
 
 		 329 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  51.35 
 
 		 325 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  48.1 
 
 		 441 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  50 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  50 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0469  hypothetical protein  76.09 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3134  hypothetical protein  88.89 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155985  normal  0.0526505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>