27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0469 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0469  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  155  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  80.43 
 
 
323 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  80.43 
 
 
323 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  80.43 
 
 
323 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  78.26 
 
 
238 aa  76.6  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  76.09 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4133  transposase  69.57 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261032  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00517  transposase  76.09 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0408  transposase  84.62 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2834  hypothetical protein  63.64 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  58.7 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  49.02 
 
 
463 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  50 
 
 
325 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  50 
 
 
325 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  50 
 
 
441 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  50 
 
 
497 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  49.02 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  49.02 
 
 
321 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  49.02 
 
 
333 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  50 
 
 
325 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  50 
 
 
333 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  50 
 
 
329 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  50 
 
 
325 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  50 
 
 
327 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  47.83 
 
 
325 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  47.83 
 
 
325 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  39.13 
 
 
329 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>