28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2834 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2834  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  196  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  77.61 
 
 		 323 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  77.61 
 
 		 323 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  76.12 
 
 		 238 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  76.12 
 
 		 323 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  60.44 
 
 		 323 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00517  transposase  76.67 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  45.45 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0408  transposase  85.11 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  47.25 
 
 		 321 aa  77.4  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  47.25 
 
 		 321 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  47.25 
 
 		 333 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  45.05 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  45.05 
 
 		 325 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  45.05 
 
 		 497 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  45.05 
 
 		 325 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  45.05 
 
 		 441 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  43.96 
 
 		 325 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  43.96 
 
 		 325 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  53.85 
 
 		 329 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  53.85 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  53.85 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  53.85 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0469  hypothetical protein  71.74 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4133  transposase  61.11 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261032  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3134  hypothetical protein  62.79 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155985  normal  0.0526505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  37.36 
 
 		 329 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>