More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0761 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0761  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecD  100 
 
 		 322 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0665  transport system permease protein  95.96 
 
 		 322 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  49.32 
 
 		 318 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  49.29 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  45.2 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  48.34 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  46.84 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  46.84 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  46.84 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  46.84 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  46.84 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0972  iron-dicitrate transporter subunit FecD  49.64 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  41.61 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  38.92 
 
 		 322 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  38.92 
 
 		 322 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  38.14 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  38.14 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  38.74 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  38.14 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.72 
 
 		 337 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  37.84 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.7 
 
 		 678 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  38.1 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  36.5 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.97 
 
 		 678 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.97 
 
 		 678 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.97 
 
 		 678 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.97 
 
 		 678 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  36.2 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  36.2 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  36.2 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  34.47 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  38.08 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.24 
 
 		 644 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  34.16 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.24 
 
 		 678 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.61 
 
 		 678 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  36.72 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  36.72 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  36.93 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  34.46 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  36.93 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  38.32 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  34.37 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  38.51 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  34.37 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  34.37 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  33.75 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  34.37 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4778  transport system permease protein  49.44 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  35.42 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  36.65 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  41.42 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  39.34 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  40.66 
 
 		 353 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  38.14 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  38.63 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.03 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  31.96 
 
 		 354 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  32.41 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.82 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  32.41 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  35.58 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  35.58 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  35.58 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.82 
 
 		 704 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  41.13 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1813  transport system permease protein  37.1 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  38.57 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  35.19 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.25 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  40.57 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  38.19 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.19 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.19 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  38.19 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.93 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.01 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>