More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4778 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4778  transport system permease protein  100 
 
 
329 aa  603  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  46.93 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  45.7 
 
 
323 aa  252  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  48.34 
 
 
323 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  45.39 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  48.53 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  48.53 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  48.53 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  48.53 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  48.53 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  44.21 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  44.21 
 
 
338 aa  231  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  44.21 
 
 
338 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  43.86 
 
 
338 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  44.21 
 
 
338 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  44.21 
 
 
338 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  44.21 
 
 
338 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  44.21 
 
 
338 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  43.19 
 
 
346 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  41.74 
 
 
353 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  43.19 
 
 
346 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  44.21 
 
 
338 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  43.4 
 
 
338 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.64 
 
 
678 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  43.93 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  44.81 
 
 
344 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.64 
 
 
678 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.64 
 
 
678 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.64 
 
 
678 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.64 
 
 
678 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  43.16 
 
 
338 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  41.51 
 
 
337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45 
 
 
678 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  48.35 
 
 
318 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.29 
 
 
678 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.59 
 
 
644 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  41.81 
 
 
345 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  45.1 
 
 
350 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  39.87 
 
 
352 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
352 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
352 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  40.97 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  40.19 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  40.19 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  40.19 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  40.19 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  48.24 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  41.14 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  41.14 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  40.47 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  41.14 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  41.14 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 
352 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  41.14 
 
 
342 aa  212  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 
325 aa  210  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  32.34 
 
 
337 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  32.05 
 
 
337 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  38.52 
 
 
338 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  38.52 
 
 
338 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  43.49 
 
 
351 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0972  iron-dicitrate transporter subunit FecD  48.17 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  35.67 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  40.39 
 
 
333 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  41.32 
 
 
383 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 
321 aa  198  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.88 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.76 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.88 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.88 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  46.88 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  38.04 
 
 
376 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  42.09 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.24 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  36.01 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
340 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  37.06 
 
 
328 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  41.73 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  33.75 
 
 
340 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
340 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  33.75 
 
 
340 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  33.23 
 
 
362 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  39.05 
 
 
338 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  33.75 
 
 
340 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  33.75 
 
 
340 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  44.77 
 
 
345 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  39.05 
 
 
338 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  33.44 
 
 
340 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  38.73 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  36.01 
 
 
327 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  35.37 
 
 
327 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.78 
 
 
367 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  41.83 
 
 
333 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  40.51 
 
 
348 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>