24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4508 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  98.73 
 
 
79 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  57.69 
 
 
79 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  38.96 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  38.96 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3323  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949177  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  38.96 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1449  hypothetical protein  55.7 
 
 
79 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  38.96 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  37.66 
 
 
77 aa  57  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  37.66 
 
 
77 aa  57  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  37.66 
 
 
77 aa  57  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2941  hypothetical protein  36.71 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  36.71 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  35.44 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0676  hypothetical protein  35.44 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0442  hypothetical protein  36.36 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0955  hypothetical protein  34.18 
 
 
79 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0509  hypothetical protein  40.3 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2852  hypothetical protein  36.36 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.233588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0330  hypothetical protein  36.36 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0653  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4176  hypothetical protein  29.73 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3417  hypothetical protein  36.36 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.20362  normal  0.0892674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>