22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1449 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1449  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  51.9 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  55.7 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  55.7 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0676  hypothetical protein  40.51 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  40.26 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0442  hypothetical protein  40.26 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2941  hypothetical protein  43.04 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  37.97 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0868  hypothetical protein  83.67 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  36.36 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0955  hypothetical protein  36.71 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3323  hypothetical protein  41.77 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2852  hypothetical protein  38.96 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.233588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0509  hypothetical protein  41.07 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3016  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>