20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2387 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0955  hypothetical protein  98.73 
 
 
79 aa  153  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  97.47 
 
 
79 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0676  hypothetical protein  91.14 
 
 
79 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  72.37 
 
 
77 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  71.05 
 
 
77 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  71.05 
 
 
77 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  71.05 
 
 
77 aa  114  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  69.74 
 
 
77 aa  114  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  71.05 
 
 
77 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  69.74 
 
 
77 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0442  hypothetical protein  68.42 
 
 
77 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0509  hypothetical protein  79.41 
 
 
80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2852  hypothetical protein  76.32 
 
 
77 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.233588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3417  hypothetical protein  73.97 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.20362  normal  0.0892674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  36.71 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  36.71 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  35.44 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3323  hypothetical protein  35.44 
 
 
79 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949177  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2941  hypothetical protein  34.18 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>