21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1633 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0442  hypothetical protein  87.01 
 
 
77 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  75.32 
 
 
77 aa  125  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  76.62 
 
 
77 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  74.03 
 
 
77 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  74.03 
 
 
77 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  74.03 
 
 
77 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  72.73 
 
 
77 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0676  hypothetical protein  72.37 
 
 
79 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  69.74 
 
 
79 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  68.42 
 
 
79 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0955  hypothetical protein  68.42 
 
 
79 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3417  hypothetical protein  74.03 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.20362  normal  0.0892674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2852  hypothetical protein  68.83 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.233588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0509  hypothetical protein  60 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  40.26 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  38.96 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  37.66 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3323  hypothetical protein  40.26 
 
 
79 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949177  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2941  hypothetical protein  37.66 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0641  hypothetical protein  34.67 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>