23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2346 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  97.4 
 
 		 77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  98.7 
 
 		 77 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  93.51 
 
 		 77 aa  146  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0442  hypothetical protein  75.32 
 
 		 77 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  74.03 
 
 		 77 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3417  hypothetical protein  97.4 
 
 		 77 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.20362  normal  0.0892674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  71.05 
 
 		 79 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0676  hypothetical protein  75.34 
 
 		 79 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  71.05 
 
 		 79 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0955  hypothetical protein  69.74 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2852  hypothetical protein  71.43 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.233588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0509  hypothetical protein  64.52 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  38.96 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  37.66 
 
 		 79 aa  57  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  38.96 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3323  hypothetical protein  36.36 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2941  hypothetical protein  33.77 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0641  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4176  hypothetical protein  32.05 
 
 		 80 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4093  hypothetical protein  32.05 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>