22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0653 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4176  hypothetical protein  42.31 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4093  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3712  hypothetical protein  41.79 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0330  hypothetical protein  43.59 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  38.03 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  35.53 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  34.67 
 
 		 79 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  37.33 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  35.53 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  37.33 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0955  hypothetical protein  36 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0676  hypothetical protein  34.67 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2941  hypothetical protein  35.9 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3323  hypothetical protein  35.9 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.949177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0442  hypothetical protein  32.89 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>