17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0330 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0330  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4176  hypothetical protein  78.75 
 
 
80 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4093  hypothetical protein  75.64 
 
 
78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0653  hypothetical protein  42.42 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59870  hypothetical protein  32.5 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174151  hitchhiker  0.000000000000128015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4508  hypothetical protein  32.5 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3712  hypothetical protein  36.23 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36210  hypothetical conserved  36.84 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1171  hypothetical protein  29.49 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1405  hypothetical protein  30.77 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0697998  normal  0.873262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2346  hypothetical protein  29.49 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000285142  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1263  hypothetical protein  29.49 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1191  hypothetical protein  29.49 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.035309  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4172  hypothetical protein  29.49 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0877912  normal  0.885294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1633  hypothetical protein  32.05 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2387  hypothetical protein  28.57 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2193  hypothetical protein  27.27 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>