26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1034 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1034  invasion gene expression up-regulator SirB  100 
 
 		 118 aa  223  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3144  invasion gene expression up-regulator, SirB  39.17 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0881039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3453  invasion gene expression up-regulator, SirB  32.17 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3550  SirB family protein  35.16 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1287  Invasion gene expression up-regulator SirB  38.54 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2379  invasion gene expression up-regulator, SirB  37.04 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3677  invasion gene expression up-regulator SirB  34.04 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2560  invasion gene expression up-regulator, SirB  35.79 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0147676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2907  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.91 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.493009  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3734  invasion gene expression up-regulator SirB  31.91 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0700  invasion gene expression up-regulator SirB  31.91 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3611  invasion gene expression up-regulator SirB  31.91 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0384528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3543  Invasion gene expression up-regulator SirB  31.91 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.637299  hitchhiker  0.0000269359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0806  invasion gene expression up-regulator, SirB  29.79 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0922  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.91 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3166  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.85 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0800  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.85 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0772  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.85 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2564  hypothetical protein  31.91 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.44085  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3830  hypothetical protein  29.79 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3124  invasion gene expression up-regulator SirB  31.25 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0944  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0999  invasion gene expression up-regulator, SirB  37.89 
 
 		 126 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1689  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000187048  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2077  invasion gene expression up-regulator, SirB  36.56 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0412299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>