65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2121 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3620  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.242629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2121  putative lipoprotein  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3963  hypothetical protein  80.82 
 
 		 73 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2134  hypothetical protein  77.03 
 
 		 74 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2350  lipoprotein, putative  77.03 
 
 		 74 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1638  hypothetical protein  90.41 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1662  hypothetical protein  93.15 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1742  hypothetical protein  69.86 
 
 		 73 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24880  putative lipoprotein  87.67 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2127  putative lipoprotein  87.67 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4527  hypothetical protein  65.75 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0929  hypothetical protein  63.01 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32890  hypothetical protein  67.12 
 
 		 73 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158478  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2798  putative lipoprotein  71.19 
 
 		 73 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.362317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6327  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72900  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2366  lipoprotein, putative  44.12 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2150  hypothetical protein  44.12 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000748705  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2688  hypothetical protein  41.51 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252919  hitchhiker  0.000204725 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0087  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.495036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0086  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0090  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.35009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2995  protein of unknown function DUF903  37.5 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0086  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0089  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127117  hitchhiker  0.00104858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3274  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000879624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3235  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00978662  hitchhiker  0.00000128975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3335  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0912863  hitchhiker  0.00963527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3154  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0064059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3172  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0402185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3220  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0872194  hitchhiker  0.00083353 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02681  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000141859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4100  putative lipoprotein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000614295  hitchhiker  0.000976754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3378  protein of unknown function DUF903  29.85 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0926  hypothetical protein  29.85 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000581798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02642  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000197879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3029  putative lipoprotein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2981  putative lipoprotein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00287278  hitchhiker  0.00772331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0857  protein of unknown function DUF903  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000668343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0882  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0181555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3806  hypothetical protein  34.72 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638343  unclonable  0.0000000198345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3153  putative lipoprotein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000699395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2980  putative lipoprotein  30 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3827  hypothetical protein  33.82 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00127821  normal  0.447388 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05819  hypothetical protein  31.75 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3061  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02660  hypothetical protein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0879  protein of unknown function DUF903  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02621  hypothetical protein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4074  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000281927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2953  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3115  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0903  hypothetical protein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2950  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3309  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00054484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3129  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000119893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3146  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000180237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3194  hypothetical protein  28.77 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0360225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3209  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00813099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000185  hypothetical protein  39.13 
 
 		 47 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3401  protein of unknown function DUF903  34.92 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000105559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0900  hypothetical protein  33.85 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00652326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3255  hypothetical protein  26.47 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>