22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2688 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252919  hitchhiker  0.000204725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2366  lipoprotein, putative  63.51 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2150  hypothetical protein  64.86 
 
 		 74 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000748705  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0929  hypothetical protein  42.03 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2350  lipoprotein, putative  40.28 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2134  hypothetical protein  40.28 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3963  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4527  hypothetical protein  39.13 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1742  hypothetical protein  40.3 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72900  putative lipoprotein  38.03 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6327  putative lipoprotein  38.03 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32890  hypothetical protein  42.59 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158478  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2798  putative lipoprotein  42.59 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.362317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3620  hypothetical protein  40.38 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.242629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2127  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2121  putative lipoprotein  40.38 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24880  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1662  hypothetical protein  36.54 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1638  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3827  hypothetical protein  34.38 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00127821  normal  0.447388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3401  protein of unknown function DUF903  30 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000105559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2995  protein of unknown function DUF903  30.56 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>